La historia se centra en los hermanos Edward y Alphonse Elric, quienes viven en un peque\u00f1o pueblo de un pa\u00eds ficticio llamado Amestris. Su padre, Hohenheim, se hab\u00eda marchado de su casa cuando a\u00fan eran peque\u00f1os y a\u00f1os m\u00e1s tarde su madre, Trisha Elric, muere por una enfermedad terminal, dejando a los hermanos Elric solos. Despu\u00e9s de la muerte de su madre, Edward decide resucitarla a trav\u00e9s de la alquimia, una de las t\u00e9cnicas cient\u00edficas m\u00e1s avanzadas conocidas por el hombre. Sin embargo, el intento resulta fallido y como consecuencia Edward pierde su pierna izquierda, y Alphonse su cuerpo. En un esfuerzo por salvar a su hermano, Edward sacrifica su brazo derecho para sellar el alma de Alphonse en una armadura. Tras esto, un alquimista llamado Roy Mustang visita a los hermanos Elric y le propone a Edward convertirse en un miembro de las Fuerzas Armadas del Estado y as\u00ed encontrar una forma de recuperar sus cuerpos. Posteriormente la pierna izquierda y el brazo derecho de Edward son sustituidos por un Automail, un tipo de pr\u00f3tesis avanzada creada por su amiga Winry Rockbell y la abuela de \u00e9sta, Pinako.\n\nEdward se propone convertirse en un alquimista estatal y luego de pasar un arduo examen, logra alcanzar el rango deseado, por lo que se le da el nombre de \u00abalquimista de acero\u00bb. En su b\u00fasqueda de la piedra filosofal, los hermanos Elric luchan contra varias personas as\u00ed como con diversos antagonistas, de los cuales algunos tambi\u00e9n buscan la piedra; entre ellos se encuentra Scar, uno de los supervivientes de la guerra de Ishbal que busca vengarse de los alquimistas estatales por la destrucci\u00f3n de su raza, y los hom\u00fanculos, un grupo de criaturas con apariencia humana que tienen la habilidad de regenerarse de cualquier herida debido a que poseen fragmentos falsos de la piedra filosofal. A medida que la historia progresa, Edward y Alphonse descubren que Amestris hab\u00eda sido creado por los hom\u00fanculos y, en secreto, controlaban al ej\u00e9rcito. Asimismo descubren que algunos de los oficiales de alto rango son controlados por el creador de los hom\u00fanculos, un hombre conocido como \u00abFather\u00bb, quien planeaba utilizar Amestris como un c\u00edrculo de transmutaci\u00f3n gigante y as\u00ed transmutar todo el pa\u00eds en una piedra filosofal. Cuando Edward y Alphonse descubren los planes del Padre, junto a otros miembros de las Fuerzas Armadas del Estado, deciden derrotarlo.<\/p>